Жиро клиринг систем је систем међубанкарског клиринга за трансакције у износу мањем или једнаком 10.000,00 конвертибилних марака. У систему учествују учесници који имају одобрење за обављање послова платног промета као и Централна банка БиХ. Трансакције које иду путем Жироклиринга се извршавају истог дана када су запримљене у циклусу поравнања за које су упућене. Клиринг платних налога свих учесника Жироклиринга извршава се утврђивањем нето позиције сваког појединачног учесника као резултат обрачуна свих потраживања и дуговања учесника за сваки клириншки циклус.

Прикупљање налога, клиринг и поравнање нето позиција изводи се кроз етапе у одређеним временским периодима, сходно Оперативним правилима за Жироклиринг и Одлуци о распореду рада и дневним активностима у Жироклирингу.

Поравнање нето позиција учесника Жироклиринга се изводи у терминима 09.30, 11.30, 13.30 и 15.30. те се исто извршава преко рачуна за поравнање у БПРВ, а у складу с Одлуком о утврђивању оперативних правила БПРВ-а. Поравнање се сматра коначним и неопозивим у тренутку када су нето позиције свих учесника извршене на рачунима за поравнање у БПРВ.

У Босни  и Херцеговини се користи децентрализована мрежа Жироклиринга. То значи да постоје три Жироклиринг подручја/бранча (Жироклиринг Главне јединице Сарајево – Жироклиринг бранчСарајево, Жироклиринг Главне банке РС ЦББиХ – Жироклиринг бранч Бања Лука и Жироклиринг Главне јединице Мостар – Жироклиринг бранч Мостар) те централни Жироклиринг – Жироклиринг центар који се налази у Централном уреду ЦББиХ.

Учесници усмјеравају налоге према:

a)      Жироклиринг центру – за налоге према банкама с отвореним рачуном резерви у организационој јединици Централне банке различитом од оног у којем банка пошиљалац налога има отворен рачун резерви и

б)  Жироклиринг бранч – за налоге према банкама с отвореним рачунимa резерви у организационој јединици Централне банке истом као онај у којем банка пошиљалац налога има отворен рачун резерви и то:

-          Жироклиринг бранч Сарајево – банке с рачуном резерви код ГЈ Сарајево,

-          Жироклиринг бранч Мостар – банке с рачуном резерви код ГЈ Мостар и

-          Жироклиринг бранч Бања Лука – банке с рачуном резерви код ГБРС Бања Лука и Филијале Пале.

    ц)   налози у корист Централне банке се шаљу на Жиро клирингцентар.

У Жироклирингу се користи SEPA формат порука, а који је у складу с ISO 20022 и верзијом Rulebooka Европског платног одбора, коју као актуелну за интерна кредитна плаћања одреди Централна банка и о томе обавијести учеснике.

Централна банка БиХ је за потребе Жироклиринга изградила банкарско-телекомуникациону мрежу, те су сви учесници повезани телекомуникационим линијама на Жироклиринг бранчеве и Жироклиринг центар.

Централна банка БиХ је донијела оперативна правила Жироклирингакојима се утврђују услови под којима Централна банка БиХ и учесници улазе у систем Жироклиринга.

Оперативним правилима за Жироклиринг утврђују се права, обавезе и одговорности Централне банке БиХ у вези с радом Жироклиринга, услове за учешће у Жироклирингу, права, обавезе и одговорности учесника Жироклиринга, начин и поступке за клиринг и поравнање те поступке у случају када учесник у Жироклирингу није у могућности испунити своје обавезе.

Централна банка БиХ наплаћује од учесника трошкове услуге обављања платних трансакција кроз систем Жироклиринга, као и накнаду за учешће у платним системима у складу с важећом тарифом накнада Централне банке БиХ. Наплата се врши задужењем рачуна резерви учесника код припадајуће главне јединице или филијале Централне банке БиХ.

Како би обезбиједила да је систем плаћања путем Жироклиринга увијек доступан, Централна банка БиХ има припремљене планове за ванредне околности с поступцима и мјерама за наставак поузданог, исправног и законитог рада Жироклиринга, најкасније у року од два сата. За Жироклиринг бранчеве, у случају недоступности, учесници шаљу налоге на Жироклиринг центар.